建立企業制度體系，最根本的目的是要實現管理科學化、提高企業效率和效益，這就要求必須首先保證科學性，而企業制度無論其具體內容針對哪一方面，歸根結底都是針對人，所以就必須充分體現“以人為本”的管理思想。設計企業制度必須同時遵守下述7項原則。
1.充分傳達企業理念
企業理念是企業文化的核心和靈魂，是制定企業制度的根本指導思想和最高原則。企業價值觀是企業制度所規范的企業一切活動的出發點，企業最高目標是它們的歸宿，企業哲學、企業宗旨、企業精神、企業道德、企業作風也分別從不同角度、不同層次對企業行為發揮決定性的作用。與企業理念相悖的企業制度不但無助于企業目標的實現，反而會產生阻礙作用，必然會處處碰壁;不能充分傳達企業理念的企業制度必然是盲目的規定和要求，對企業目標的實現不會有多大的幫助。因此，符合企業理念的主旨、體現企業理念的目標和要求是企業設計企業制度要遵守的第一原則。
2.立足企業實際需要
建立一項制度，首席要問一個“為什么”。答案當然是因為企業生產經營管理等工作有需要。企業實際工作的需要是設計和建立企業制度的唯一目的，也是企業制度存在的價值。只有符合國情和企業實際，次啊能滿足企業管理工作的需要，充分體現企業的特色。
為此，企業制度設計要努力做到四點。第一，根據企業需要來決定制度體系的構成，在借鑒發達國家和其他企業管理制度經營的時候切忌不加取舍地盲目照抄照搬。第二，根據本企業員工的具體情況來擬定各項制度的內容，使制度不僅體現企業最高領導者的信心和決心，也與員工隊伍的整體素質相適應，以利于他們能夠很好地理解、接受和執行。第三，把企業實踐作為檢驗企業制度有效與否的唯一標準，并根據管理實踐及時評價和修訂、完善企業的制度。第四，充分反映本企業的管理特色，因為好的企業制度體系是對企業理念、企業的行業特點、企業規模和業務、企業管理水平、員工隊伍狀況等企業特色的直接反映。
3.由主及次分類制定
做任何事情，都要善于抓住主要矛盾和矛盾的主要方面，企業制度的設計也是如此。一般來說，應該首先制定那些涉及面最廣、對企業運行最為重要的主要制度，然后以這些主要制度為框架，分門別類地擬定其他的次要的制度或帶有補充規定性質的制度。按照這一原則制定出來的企業制度體系，系統性強，結構清晰，主次得當，而且不容易出現遺漏，即不同意出現制度約束不到的“，盲點”和“死角”。
國際連鎖企業管理協會的品牌研究人員認為，無論什么性質、何種行業、多大規模的企業，財務制定、生產經營管理制度、人事制度、分配制度等都是主要的管理制度，有了這些主要制度，企業的運行就有了基本的“準繩”。在此基礎上，根據企業自身特點再制定其他的有關制度就有章可循了。
有了主要的管理制度之后，著手制定其他的制度時就應該把重點放在各項責任上。如果沒有領導干部責任制、職能不能和人員的責任制、員工的崗位責任制，企業的各項管理制度由誰來執行呢?從重要性來看，各項特殊制定一般總是最后制定。
4.相互兼顧整體協調
企業制度體系中的各項制度都規范著某方面工作或某些崗位的工作，這些制度交織起來使得企業里每位員工各司其職、每項工作有條不紊地進行，以促成企業目標的實現。為達此目的，就要求企業制度設計必須堅持相互兼顧、整體協調的原則。
具體來說，這一原則包含以下幾個方面要求。第一，唯一性，即每件事只能有一項制度來規范，如果一件事情有多項制度來約束，難免這些制度自身可能出現不協調的地方，實際上就等于沒有制度了。第二，一致性，即所有制度應該保持，不能相互矛盾，不僅新制度與老制度相悖，而且要立新則必須除舊，同時不能先除舊再立新，否則就會在企業里出現一段時間的“制度真空”。第三，順向性，即次要制度服從主要制度，制定制度的順序職能是從主要制度到次要制度的單一方向，而不能逆向進行。第四，完備性，即所有制度要盡量閉合，企業制度體系要健全，保證企業的每一名員工、每一項工作都在制度的約束下。
5.剛柔相濟寬嚴有度
制度的剛性是維持其嚴肅性和有效性的基礎，失去剛性，制度就失去了存在的價值。試想，如果產品尺寸可以隨意有誤差、飯店的餐巾(紙)可有可無，這樣的企業制度等于沒有制度。因此，設計制度應力求嚴格，保證足夠的剛性，這是管理科學化的一個重要體現。
國際連鎖企業管理協會的企業研究專家認為，企業處在復雜多變的環境中，各項工作經常受到各種內外因素的影響，為了在這種不斷變化的內外環境中保持制度體現的有效性、保證企業的高效有序運轉，又必然要求企業的管理制度、責任制度及特殊制度要充分考慮對為了一些變化的適應性，即具備一定的彈性。例如，有關產品質量規范是剛性最強的制度，但質量標準的“允許誤差范圍”則體現了制度的彈性。
貫徹這一原則的具體要求是：第一，在涉及企業生存發展重要方面的制度(例如生產安全制度、質量管理制度、財務管理制度、崗位責任制度等)要嚴格規范、力求剛性，而在影響較小的次要方面的制度可適度放寬要求，使之保持一定的彈性;第二，偏重于“物”的管理方面的制度(例如質量檢驗、物資設備管理、財務管理等制度)應強調剛性，而偏重于“人”的管理方面的制度 (例如員工教育培訓、政治思想工作等制度)則必須要考慮靈活性;第三，有長期反復的時間作為基礎的企業制度(例如財務制度)往往剛性強一些，而缺乏實踐經驗的制度(例如技術創新管理的制度)則要求彈性大一些;第四，與組織結構特點相適應，針對操作層次、執行層次的制度要充分體現剛性，因為操作層、執行層基本上都是比較簡單具體、反復出現、程序性強的問題，不可能有管理上的隨意性，而在決策層次、管理層次的制度則要充分體現彈性，因為決策層和管理層遇到的問題往往具有特殊性、非程序化等特點。
6.與時俱進不斷創新
任何的企業制度，再好的企業制度，都是特定的企業和一定的歷史條件的產物。當形成制度的特定條件和內外環境變化以后，企業某項制度的必要性可能不復存在了，就必須進行改革和創新，否則不僅不能起到應有的作用，反而會約束和阻礙企業的進一步發展。當前，人類生產力快速發展，國際上企業面臨的政治經濟文化環境快速變化，特別是我國經濟設計處在新的發展階段，正面臨從工業化想信息化的過渡。因此，我國企業必須隨著企業自身和國家經濟社會的發展而不斷進行制度創新，通過制度創新來進一步解放和發展生產力，增強企業的競爭優勢。從這個意義上講，在建設創新型國家的歷史進程中，中國企業不僅要承擔技術創新、產品創新等任務，而且還承擔著制度創新、管理創新的責任。
7.條理清楚簡明實用
企業制度體系不是企業的擺設，而是企業正常、高效、有序運行的重要保證。要使制度充分發揮對企業組織和員工的規范、約束作用，在設計制度時就應該盡量做到條理清楚、簡明實用。堅持這一原則，主要體現在三個層次。一是宏觀層次。在企業整個制度體現結構合理的前提下，盡量做到每項制度都具有明確的針對性和界限清楚的適用范圍。泛泛而談、試圖面面俱到的企業制度往往最缺乏針對性，也最沒用實用價值。二是中觀層次。每項制度都力求條理化，做到結構嚴謹、邏輯性強。三是微觀層次，每一條制度要做到用詞規范、句式簡潔、表達清楚，要盡量避免不必要的修飾。
