連鎖總部是連鎖企業經營管理的核心，它除了自身具有決策職能、監督職能外，主要承擔整體經營的設計功能，其基本職能是：基本政策制定、連鎖門店開發、商品采購管理、商品配送管理、資金運作管理、商品促銷管理以及門店營運督導等。
1、基本政策制定
連鎖企業內部的基本政策是本企業連鎖經營管理應遵循的方向，主要包括以下六個方面。
(1)制定發展戰略。
(2)明確組織形態。
(3)商品采購政策。
(4)確立配送模式。
(5)商品銷售政策。
(6)勞動人事政策。
2、連鎖門店開發
(1)開店操作規范。
(2)開店作業流程。
3、商品采購管理
連鎖企業總部應注意解決好的問題：
一是除堅持不折不扣地統一進貨制度外，應特別注意做好采購部經理、采購部工作人員的選擇與配備，加強監控，把好商品關，不允許出現黑洞和不利于企業發展的潛流;
二是主力商品的選擇與培養是連鎖企業商品采購的工作重點;
三是狠抓商品的適銷率，商品的適銷率的高低，最終反映了商品周轉率的高低，總部的采購部則要對整個連鎖企業的銷售負責;
四是抓采購計劃的準確性，努力做到以量壓價，以降低進貨成本，尤其是為保證主力商品貨源供應的正常性，應制定主力商品的年度采購計劃。
4、商品配送管理
一是配送中心的規模和配送能力要與本連鎖企業的發展規模和銷售能力相適應，通常要保證配送的能力適當超出門店的銷售能力，既不要造成配送能力大量放空的現象，也不要由于庫存量過小和運輸過緊而影響門店的銷售;
二是在確保門店商品銷售不缺貨的前提條件下，不一味強調配送時間的準時性而盲目地增加配送次數，應該有精確的計算，將物流成本細化到單品;
三是提高商品的拆零組配率，以盡量減少門店的商品庫存，減輕門店工作人員的勞動強度;四是界定好配送中心對門店服務的具體標準，如配送次數、訂貨和配送到達的時間限制和每次最低配送量等。
5、資金運作管理
一是安排好進貨資金、在途商品資金、庫存商品資金、貨款結算資金和發展資金的比例，在資金緊張的條件下，應重點保證進貨資金和發展資金的使用;
二是抓好銷售款項回籠至總部的時間控制，嚴肅在此工作中的紀律;
三是嚴格履行對供應商的商品貨款的結算制度，做到準時定額，以樹立連鎖企業良好的資信。
6、商品促銷管理
7、門店營運督導
8、信息化建設
總部應盡快建立和完善電子信息系統，大力促進商業活動信息化、智能化、網絡化。
連鎖企業要提高經營管理的規范化水平，重點應完善連鎖企業總部的功能，發展總部在采購配送、經營指導、市場開發、促銷策劃、教育培訓、信息化等方面的職能;提高總部統一采購配送的比例;完善連鎖企業內部各個環節的管理，建立健全各個崗位、各道工序、各項作業的規章制度。
